En un orden cronológico indeterminado, tratando
las particulares circunstancias de los diversos
científicos e integrantes de la unidad de seguridad
de las instalaciones y la Unidad de Combate en
Entornos Peligrosos conocida como H.E.C.U.
(Hazardous Environment Combat Unit en inglés),
la cual ha sido constituida para ingresar en las
instalaciones y eliminar a todo individuo capaz de
testificar sobre cualquier incidente ocurrido.
El protagonista es un científico de 27 años de edad
llamado Gordon Freeman, especializado en física teórica
por el Massachusetts Institute of Technology (MIT) al
que le toca realizar un experimento con una muestra de
un mineral desconocido, en el espectrómetro de antimateria
del Sector C (Materiales Anómalos) de los laboratorios de
Black Mesa. Durante el experimento ocurre una secuencia de resonancias, que provoca la teletransportación de
extraterrestres por toda la instalación.
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